故事的舞台位於流傳著諸多神話，坐擁豐富大自然的「神奧地區」。以在湖畔邊被發現，博士所遺落的手提箱為契機，與寶可夢們交織出的故事開始轉動。奧地區既有廣大的湖和雪原等，能感受到壯闊的大自然的場所；也有百貨公司和大樓林立的先進城市，在這裡能欣賞到多彩多姿的景致。
本次在「伽勒爾地區」登場的御三家是草苗龜、小火焰猴和波加曼。
在本作的遊戲包裝上登場的傳說的寶可夢「帝亞盧卡」擁有操縱時間的力量。在神奧地區被稱為神，並在神話中登場；「帕路奇亞」擁有扭曲空間的能力。在神奧地區的神話裡被描述為神。
【地下大洞窟】
《寶可夢 鑽石／珍珠（ポケットモンスター ダイヤモンド・パール）》的「地下通道」將在本作以「地下大洞窟」之姿升級登場！「地下大洞窟」是像迷宮般盤根錯節，延伸至神奧地區全境的地下世界。在冒險途中得到「探險組合」後，就可以使用它前往。在「地下大洞窟」裡，你能挖掘到珍貴的道具和寶可夢的化石，建造專屬於自己的秘密基地，以及在「寶可夢秘巢」這種地方遇見棲息於各種環境的寶可夢。
很多客人都會詢問要選劍還是盾? 兩個版本最主要是封面上的神獸，覺得帝亞盧卡很帥先買晶燦鑽石，覺得帕路奇亞很酷先買明亮珍珠，要蒐集全部圖鑑兩片都需要。如果只購買一片的朋友，沒關係，還是可以透過跟不同版本的朋友交換來獲得遇不到的寶可夢喔！例如：《寶可夢 晶燦鑽石》裡有頭蓋龍、臭鼬噗等寶可夢登場；《寶可夢 明亮珍珠》裡有盾甲龍、魅力喵等寶可夢登場等。
更詳細介紹來看看影片八~
