在洗翠地區有個人們熙來攘往的村子「祝慶村」，主角將會住在位於祝慶村的宿舍中，並以這個村子為據點出發去冒險。天冠山頂的上空有一部分出現龜裂，顏色也變得和一般的天空不同。洗翠地區的人們稱之為「時空裂縫」，視其為一種無法理解的現象並且感到恐懼。造成這個現象的原因好像和某隻寶可夢的力量有關。
本次在「洗翠地區」登場的御三家是木木梟、火球鼠和水水獺。
在本作登場的傳說的寶可夢「阿爾宙斯」、「帝亞盧卡 (起源型態)」和「帕路奇亞 (起源型態)」。
【寶可騎行】
主角在冒險中收下的「神闔之笛」是在洗翠地區被代代傳承下來的不可思議的笛子。只要吹奏這支笛子，不論在什麼時候，特別的寶可夢都會現身來供主角騎乘。
【頭目寶可夢】
在冒險的途中，有時候會遇到體型大於一般同類，眼睛發著紅光的寶可夢「頭目」。牠們的力量格外強大，而且一察覺到主角就會追上來攻擊。遇見「頭目」時就巧妙地閃避攻擊，並且發起寶可夢對戰吧。雖然牠很不好應付，但若能順利捕捉，牠應該就會是可靠的夥伴。此外，透過對戰打倒「頭目」的話，有時似乎還能得到稀有的道具呢。
更詳細介紹來看看影片八~
